太岁元辰殿于2007年着手筹建，位处第一参神平台地底；于2011年初迎来啬色园九十周年庆典时建成，供奉斗姆元君、太岁及元辰，总面积约一万平方呎，位于黄大仙祠大殿下方的地下宫殿。殿堂设计糅合现代科技元素，同时维持传统风格及固有道教文化。
主殿以「斗姆元君」」圣像为中心，顺时针围绕着六十太岁像，所有神像均以中国传统生漆胎脱法制造，为中国硕果仅存的手艺。主殿外形上契合我国古代天圆地方之世界观，顶部为大型「星象天幕」，乃根据古天文星相，配合上百颗现代节能LED灯，营造「春夏」、「秋冬」两大季节之香港星象。天幕以四根廿八星宿圆柱连接；地面中央特设两仪及先天八卦透光地雕，与天幕互相呼应。而前面则摆放寓意「道祖守护香江」的「五行运转香江」锻铜工艺。
牌匾更获国学大师饶宗颐教授惠赐题字，而对联则由时任中国道教协会会长任法融道长所题赠。
此外，殿内更体现环保庙宇的精神，全殿装置均以环保节能为原则，以檀香取代传统线香，减低因上香造成的碳排放，使殿内环境更清幽自然。2020年太岁元辰殿进行翻修，在殿内新增神仙彩绘壁画，更添庄严意韵。