藥王殿於2011年建成,殿內供奉道教藥王─孫思邈真人。孫真人乃唐朝著名醫師與道士,宋時被追封為「妙應真人」。孫真人以著述、治病見稱,且精通老莊、醫藥等學問,其理論以預防為先,食療為主,清心寡欲為副,並輔以胎息、內視、閉息、吐氣等服氣修持方法,後世推崇為「藥王」。本園藥王寶誕為農曆四月廿八日。
1921年4月本園擇定竹園後,蒙文昌帝君乩示,擇吉六月廿四日興工,初期大仙祠規模簡單,只建大殿、麟閣、辦事處、宿舍、大閘、水井等工程,其後才不斷添建其他建築物。
後於1937年得仙師乩示:謂欲本園永垂久遠,建築須配合五行,謂之「五形」。飛鸞台「金」形,經堂「木」形,玉液池「水」形,盂香亭「火」形,照壁「土」形。金、木、水、火、土五行齊備,方能鞏固。